Protein–RNA interactions for Protein: Q96KR7

PHACTR3, Phosphatase and actin regulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR3Q96KR7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PHACTR3Q96KR7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PHACTR3Q96KR7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PHACTR3Q96KR7 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PHACTR3Q96KR7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PHACTR3Q96KR7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PHACTR3Q96KR7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PHACTR3Q96KR7 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PHACTR3Q96KR7 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PHACTR3Q96KR7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PHACTR3Q96KR7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PHACTR3Q96KR7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PHACTR3Q96KR7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PHACTR3Q96KR7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PHACTR3Q96KR7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PHACTR3Q96KR7 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PHACTR3Q96KR7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PHACTR3Q96KR7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PHACTR3Q96KR7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PHACTR3Q96KR7 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PHACTR3Q96KR7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PHACTR3Q96KR7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PHACTR3Q96KR7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PHACTR3Q96KR7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PHACTR3Q96KR7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PHACTR3Q96KR7 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PHACTR3Q96KR7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PHACTR3Q96KR7 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PHACTR3Q96KR7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PHACTR3Q96KR7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PHACTR3Q96KR7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms