Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX7

TRIM44, Tripartite motif-containing protein 44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM44Q96DX7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms