Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0U6

LINC00518, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00518, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00518Q8N0U6 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms