Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LMBR1LQ6UX01 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LMBR1LQ6UX01 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
LMBR1LQ6UX01 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
LMBR1LQ6UX01 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMBR1LQ6UX01 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMBR1LQ6UX01 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMBR1LQ6UX01 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMBR1LQ6UX01 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMBR1LQ6UX01 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMBR1LQ6UX01 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMBR1LQ6UX01 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMBR1LQ6UX01 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMBR1LQ6UX01 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
LMBR1LQ6UX01 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMBR1LQ6UX01 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMBR1LQ6UX01 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMBR1LQ6UX01 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMBR1LQ6UX01 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMBR1LQ6UX01 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMBR1LQ6UX01 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMBR1LQ6UX01 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMBR1LQ6UX01 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
LMBR1LQ6UX01 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMBR1LQ6UX01 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
LMBR1LQ6UX01 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMBR1LQ6UX01 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMBR1LQ6UX01 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMBR1LQ6UX01 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMBR1LQ6UX01 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMBR1LQ6UX01 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMBR1LQ6UX01 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMBR1LQ6UX01 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMBR1LQ6UX01 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMBR1LQ6UX01 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMBR1LQ6UX01 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
LMBR1LQ6UX01 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMBR1LQ6UX01 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMBR1LQ6UX01 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMBR1LQ6UX01 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
LMBR1LQ6UX01 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMBR1LQ6UX01 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMBR1LQ6UX01 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMBR1LQ6UX01 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMBR1LQ6UX01 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMBR1LQ6UX01 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms