Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSX1

CCDC70, Coiled-coil domain-containing protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC70Q6NSX1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms