Protein–RNA interactions for Protein: Q66K89

E4F1, Transcription factor E4F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4F1Q66K89 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms