Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
NBPF1Q3BBV0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NBPF1Q3BBV0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NBPF1Q3BBV0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NBPF1Q3BBV0 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NBPF1Q3BBV0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NBPF1Q3BBV0 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
NBPF1Q3BBV0 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NBPF1Q3BBV0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NBPF1Q3BBV0 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NBPF1Q3BBV0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
NBPF1Q3BBV0 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
NBPF1Q3BBV0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NBPF1Q3BBV0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NBPF1Q3BBV0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NBPF1Q3BBV0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NBPF1Q3BBV0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NBPF1Q3BBV0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NBPF1Q3BBV0 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NBPF1Q3BBV0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NBPF1Q3BBV0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NBPF1Q3BBV0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NBPF1Q3BBV0 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NBPF1Q3BBV0 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NBPF1Q3BBV0 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NBPF1Q3BBV0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NBPF1Q3BBV0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NBPF1Q3BBV0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NBPF1Q3BBV0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NBPF1Q3BBV0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NBPF1Q3BBV0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NBPF1Q3BBV0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NBPF1Q3BBV0 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NBPF1Q3BBV0 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NBPF1Q3BBV0 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NBPF1Q3BBV0 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
NBPF1Q3BBV0 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NBPF1Q3BBV0 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
NBPF1Q3BBV0 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
NBPF1Q3BBV0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NBPF1Q3BBV0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NBPF1Q3BBV0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NBPF1Q3BBV0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NBPF1Q3BBV0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NBPF1Q3BBV0 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NBPF1Q3BBV0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NBPF1Q3BBV0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NBPF1Q3BBV0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
NBPF1Q3BBV0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NBPF1Q3BBV0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NBPF1Q3BBV0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NBPF1Q3BBV0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NBPF1Q3BBV0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NBPF1Q3BBV0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NBPF1Q3BBV0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NBPF1Q3BBV0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NBPF1Q3BBV0 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NBPF1Q3BBV0 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NBPF1Q3BBV0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NBPF1Q3BBV0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NBPF1Q3BBV0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NBPF1Q3BBV0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NBPF1Q3BBV0 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
NBPF1Q3BBV0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NBPF1Q3BBV0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NBPF1Q3BBV0 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NBPF1Q3BBV0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NBPF1Q3BBV0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NBPF1Q3BBV0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NBPF1Q3BBV0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NBPF1Q3BBV0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NBPF1Q3BBV0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NBPF1Q3BBV0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NBPF1Q3BBV0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NBPF1Q3BBV0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NBPF1Q3BBV0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NBPF1Q3BBV0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NBPF1Q3BBV0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NBPF1Q3BBV0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NBPF1Q3BBV0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NBPF1Q3BBV0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NBPF1Q3BBV0 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NBPF1Q3BBV0 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NBPF1Q3BBV0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
NBPF1Q3BBV0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
NBPF1Q3BBV0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NBPF1Q3BBV0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NBPF1Q3BBV0 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NBPF1Q3BBV0 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NBPF1Q3BBV0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NBPF1Q3BBV0 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NBPF1Q3BBV0 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NBPF1Q3BBV0 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NBPF1Q3BBV0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NBPF1Q3BBV0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NBPF1Q3BBV0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NBPF1Q3BBV0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NBPF1Q3BBV0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NBPF1Q3BBV0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NBPF1Q3BBV0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms