Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NBR1Q14596 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NBR1Q14596 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NBR1Q14596 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NBR1Q14596 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NBR1Q14596 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NBR1Q14596 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NBR1Q14596 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NBR1Q14596 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NBR1Q14596 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NBR1Q14596 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NBR1Q14596 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NBR1Q14596 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NBR1Q14596 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NBR1Q14596 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NBR1Q14596 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NBR1Q14596 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NBR1Q14596 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NBR1Q14596 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NBR1Q14596 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NBR1Q14596 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NBR1Q14596 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NBR1Q14596 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NBR1Q14596 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NBR1Q14596 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NBR1Q14596 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NBR1Q14596 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NBR1Q14596 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NBR1Q14596 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NBR1Q14596 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NBR1Q14596 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NBR1Q14596 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NBR1Q14596 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NBR1Q14596 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NBR1Q14596 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NBR1Q14596 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NBR1Q14596 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NBR1Q14596 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NBR1Q14596 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NBR1Q14596 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NBR1Q14596 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NBR1Q14596 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NBR1Q14596 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NBR1Q14596 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NBR1Q14596 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NBR1Q14596 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NBR1Q14596 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NBR1Q14596 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NBR1Q14596 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NBR1Q14596 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NBR1Q14596 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NBR1Q14596 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NBR1Q14596 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NBR1Q14596 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NBR1Q14596 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NBR1Q14596 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NBR1Q14596 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NBR1Q14596 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NBR1Q14596 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NBR1Q14596 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NBR1Q14596 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NBR1Q14596 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NBR1Q14596 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NBR1Q14596 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NBR1Q14596 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NBR1Q14596 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NBR1Q14596 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NBR1Q14596 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NBR1Q14596 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NBR1Q14596 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NBR1Q14596 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NBR1Q14596 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NBR1Q14596 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NBR1Q14596 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NBR1Q14596 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NBR1Q14596 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NBR1Q14596 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NBR1Q14596 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NBR1Q14596 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NBR1Q14596 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NBR1Q14596 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NBR1Q14596 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NBR1Q14596 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NBR1Q14596 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NBR1Q14596 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NBR1Q14596 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NBR1Q14596 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NBR1Q14596 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NBR1Q14596 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NBR1Q14596 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NBR1Q14596 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NBR1Q14596 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NBR1Q14596 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NBR1Q14596 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NBR1Q14596 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NBR1Q14596 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NBR1Q14596 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NBR1Q14596 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NBR1Q14596 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NBR1Q14596 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms