Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CPSF1Q10570 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CPSF1Q10570 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CPSF1Q10570 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CPSF1Q10570 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CPSF1Q10570 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CPSF1Q10570 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CPSF1Q10570 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CPSF1Q10570 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CPSF1Q10570 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CPSF1Q10570 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CPSF1Q10570 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CPSF1Q10570 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CPSF1Q10570 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CPSF1Q10570 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CPSF1Q10570 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CPSF1Q10570 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CPSF1Q10570 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CPSF1Q10570 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CPSF1Q10570 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CPSF1Q10570 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CPSF1Q10570 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CPSF1Q10570 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CPSF1Q10570 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CPSF1Q10570 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CPSF1Q10570 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CPSF1Q10570 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CPSF1Q10570 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CPSF1Q10570 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CPSF1Q10570 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CPSF1Q10570 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CPSF1Q10570 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CPSF1Q10570 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CPSF1Q10570 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CPSF1Q10570 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CPSF1Q10570 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CPSF1Q10570 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CPSF1Q10570 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CPSF1Q10570 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CPSF1Q10570 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CPSF1Q10570 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CPSF1Q10570 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CPSF1Q10570 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CPSF1Q10570 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CPSF1Q10570 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CPSF1Q10570 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CPSF1Q10570 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CPSF1Q10570 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CPSF1Q10570 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
CPSF1Q10570 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CPSF1Q10570 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CPSF1Q10570 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CPSF1Q10570 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CPSF1Q10570 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CPSF1Q10570 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CPSF1Q10570 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CPSF1Q10570 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CPSF1Q10570 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CPSF1Q10570 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CPSF1Q10570 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CPSF1Q10570 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CPSF1Q10570 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CPSF1Q10570 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CPSF1Q10570 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CPSF1Q10570 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CPSF1Q10570 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CPSF1Q10570 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CPSF1Q10570 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CPSF1Q10570 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CPSF1Q10570 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CPSF1Q10570 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CPSF1Q10570 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CPSF1Q10570 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CPSF1Q10570 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CPSF1Q10570 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CPSF1Q10570 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CPSF1Q10570 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CPSF1Q10570 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CPSF1Q10570 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CPSF1Q10570 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CPSF1Q10570 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CPSF1Q10570 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CPSF1Q10570 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CPSF1Q10570 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CPSF1Q10570 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CPSF1Q10570 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CPSF1Q10570 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CPSF1Q10570 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CPSF1Q10570 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CPSF1Q10570 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CPSF1Q10570 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CPSF1Q10570 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CPSF1Q10570 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CPSF1Q10570 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CPSF1Q10570 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CPSF1Q10570 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CPSF1Q10570 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CPSF1Q10570 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CPSF1Q10570 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CPSF1Q10570 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
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