Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms