Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3BP58499 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3BP58499 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3BP58499 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3BP58499 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3BP58499 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3BP58499 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3BP58499 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3BP58499 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3BP58499 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3BP58499 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3BP58499 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3BP58499 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3BP58499 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3BP58499 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3BP58499 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3BP58499 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3BP58499 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3BP58499 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3BP58499 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3BP58499 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3BP58499 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3BP58499 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3BP58499 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3BP58499 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3BP58499 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3BP58499 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3BP58499 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3BP58499 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3BP58499 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3BP58499 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3BP58499 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3BP58499 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3BP58499 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3BP58499 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3BP58499 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3BP58499 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3BP58499 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM3BP58499 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM3BP58499 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM3BP58499 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM3BP58499 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM3BP58499 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM3BP58499 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM3BP58499 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM3BP58499 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM3BP58499 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM3BP58499 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM3BP58499 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms