Protein–RNA interactions for Protein: P57768

SNX16, Sorting nexin-16, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX16P57768 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX16P57768 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX16P57768 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX16P57768 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX16P57768 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX16P57768 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SNX16P57768 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX16P57768 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX16P57768 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX16P57768 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX16P57768 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX16P57768 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX16P57768 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX16P57768 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SNX16P57768 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX16P57768 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SNX16P57768 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX16P57768 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX16P57768 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX16P57768 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX16P57768 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX16P57768 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX16P57768 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX16P57768 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX16P57768 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX16P57768 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX16P57768 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX16P57768 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX16P57768 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX16P57768 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX16P57768 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX16P57768 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX16P57768 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX16P57768 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX16P57768 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX16P57768 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX16P57768 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX16P57768 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX16P57768 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX16P57768 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX16P57768 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX16P57768 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX16P57768 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX16P57768 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX16P57768 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX16P57768 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX16P57768 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX16P57768 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX16P57768 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX16P57768 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX16P57768 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX16P57768 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX16P57768 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX16P57768 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX16P57768 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX16P57768 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX16P57768 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX16P57768 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX16P57768 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX16P57768 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX16P57768 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX16P57768 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX16P57768 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX16P57768 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX16P57768 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX16P57768 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX16P57768 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX16P57768 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX16P57768 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX16P57768 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX16P57768 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX16P57768 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX16P57768 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX16P57768 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX16P57768 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX16P57768 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX16P57768 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX16P57768 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX16P57768 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX16P57768 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX16P57768 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX16P57768 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX16P57768 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX16P57768 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX16P57768 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX16P57768 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX16P57768 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX16P57768 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX16P57768 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX16P57768 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX16P57768 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX16P57768 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX16P57768 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX16P57768 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX16P57768 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX16P57768 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX16P57768 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX16P57768 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX16P57768 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX16P57768 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms