Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms