Protein–RNA interactions for Protein: P04350

TUBB4A, Tubulin beta-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4AP04350 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBB4AP04350 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBB4AP04350 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBB4AP04350 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBB4AP04350 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBB4AP04350 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBB4AP04350 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBB4AP04350 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBB4AP04350 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBB4AP04350 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBB4AP04350 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBB4AP04350 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBB4AP04350 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBB4AP04350 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBB4AP04350 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms