Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms