Protein–RNA interactions for Protein: O75113

N4BP1, NEDD4-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP1O75113 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
N4BP1O75113 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms