Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 CCS-207ENST00000531990 868 ntTSL 219.81■□□□□ 0.767e-7■■■■□ 22.1
PRPF4O43172 HEXDC-207ENST00000578775 779 ntTSL 319.66■□□□□ 0.747e-7■■■■□ 22.1
PRPF4O43172 RNPS1-212ENST00000564822 314 ntTSL 419.62■□□□□ 0.737e-7■■■■□ 22.1
PRPF4O43172 RNPS1-226ENST00000570051 735 ntTSL 219.62■□□□□ 0.737e-7■■■■□ 22.1
PRPF4O43172 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.737e-7■■■■□ 22.1
PRPF4O43172 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.77e-7■■■■□ 22.1
PRPF4O43172 PIP5K1C-208ENST00000637724 435 ntTSL 319.17■□□□□ 0.667e-7■■■■□ 22.1
PRPF4O43172 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.617e-7■■■■□ 22.1
PRPF4O43172 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.587e-7■■■■□ 22.1
PRPF4O43172 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.577e-7■■■■□ 22.1
PRPF4O43172 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.547e-7■■■■□ 22.1
PRPF4O43172 RNPS1-210ENST00000564601 903 ntTSL 318.28■□□□□ 0.527e-7■■■■□ 22.1
PRPF4O43172 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.09■□□□□ 0.497e-7■■■■□ 22.1
PRPF4O43172 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.317e-7■■■■□ 22.1
PRPF4O43172 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.317e-7■■■■□ 22.1
PRPF4O43172 RNPS1-204ENST00000561518 1092 ntTSL 516.93■□□□□ 0.37e-7■■■■□ 22.1
PRPF4O43172 CCS-204ENST00000526066 872 ntTSL 216.69■□□□□ 0.267e-7■■■■□ 22.1
PRPF4O43172 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.257e-7■■■■□ 22.1
PRPF4O43172 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.217e-7■■■■□ 22.1
PRPF4O43172 CCS-205ENST00000530384 1196 ntTSL 516.27■□□□□ 0.27e-7■■■■□ 22.1
PRPF4O43172 CCS-203ENST00000526058 593 ntTSL 416.13■□□□□ 0.177e-7■■■■□ 22.1
PRPF4O43172 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.167e-7■■■■□ 22.1
PRPF4O43172 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.077e-7■■■■□ 22.1
PRPF4O43172 PIP5K1C-204ENST00000587482 1311 ntTSL 515.45■□□□□ 0.067e-7■■■■□ 22.1
PRPF4O43172 RNPS1-209ENST00000564311 870 ntTSL 514.62□□□□□ -0.077e-7■■■■□ 22.1
PRPF4O43172 CCS-206ENST00000530961 1214 ntTSL 514.55□□□□□ -0.087e-7■■■■□ 22.1
PRPF4O43172 TSPAN9-203ENST00000431374 558 ntTSL 414.54□□□□□ -0.087e-7■■■■□ 22.1
PRPF4O43172 RNPS1-207ENST00000562690 582 ntTSL 214.19□□□□□ -0.147e-7■■■■□ 22.1
PRPF4O43172 ELOVL5-202ENST00000370913 580 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.47e-7■■■■□ 22.1
PRPF4O43172 ELOVL5-204ENST00000465983 696 ntTSL 312.15□□□□□ -0.467e-7■■■■□ 22.1
PRPF4O43172 ELOVL5-206ENST00000486973 794 ntTSL 312.01□□□□□ -0.497e-7■■■■□ 22.1
PRPF4O43172 RPS26-201ENST00000356464 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.57e-7■■■■□ 22.1
PRPF4O43172 TSPAN9-202ENST00000407263 956 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.857e-7■■■■□ 22.1
PRPF4O43172 RPS26-203ENST00000552361 623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.867e-7■■■■□ 22.1
PRPF4O43172 RPS26-202ENST00000548590 1204 ntTSL 59.24□□□□□ -0.937e-7■■■■□ 22.1
PRPF4O43172 KLF13-204ENST00000558673 447 ntTSL 34.37□□□□□ -1.717e-7■■■■□ 22.1
PRPF4O43172 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 12e-6■■■■□ 22.1
PRPF4O43172 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.542e-6■■■■□ 22.1
PRPF4O43172 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.382e-6■■■■□ 22.1
PRPF4O43172 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.12e-6■■■■□ 22.1
PRPF4O43172 SPATS2L-208ENST00000409718 2648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.352e-6■■■■□ 22.1
PRPF4O43172 SPATS2L-206ENST00000409385 2320 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.632e-6■■■■□ 22.1
PRPF4O43172 SPATS2L-219ENST00000453663 637 ntTSL 49.25□□□□□ -0.932e-6■■■■□ 22.1
PRPF4O43172 SPATS2L-207ENST00000409397 920 ntTSL 39.16□□□□□ -0.942e-6■■■■□ 22.1
PRPF4O43172 SPATS2L-201ENST00000358677 6156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.022e-6■■■■□ 22.1
PRPF4O43172 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.266e-8■■■■□ 22.1
PRPF4O43172 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.346e-8■■■■□ 22.1
PRPF4O43172 LINC01770-204ENST00000454562 424 ntTSL 316.86■□□□□ 0.296e-8■■■■□ 22.1
PRPF4O43172 SHANK2-218ENST00000601538 9062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.361e-6■■■■□ 22.1
PRPF4O43172 LPCAT1-202ENST00000475622 5610 ntTSL 518.66■□□□□ 0.589e-7■■■■□ 22.1
PRPF4O43172 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.139e-7■■■■□ 22.1
PRPF4O43172 SARDH-206ENST00000427237 1957 ntTSL 218.7■□□□□ 0.582e-6■■■■□ 22
PRPF4O43172 PPP1CB-209ENST00000464273 577 ntTSL 213.89□□□□□ -0.194e-8■■■■□ 22
PRPF4O43172 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.47■□□□□ 0.398e-16■■■■□ 22
PRPF4O43172 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.198e-16■■■■□ 22
PRPF4O43172 DPH1-213ENST00000575667 1644 ntTSL 1 (best)23.84■■□□□ 1.415e-6■■■■□ 22
PRPF4O43172 DPH1-206ENST00000571418 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 223.27■■□□□ 1.325e-6■■■■□ 22
PRPF4O43172 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.245e-6■■■■□ 22
PRPF4O43172 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.885e-6■■■■□ 22
PRPF4O43172 DPH1-211ENST00000572819 1345 ntTSL 520.52■□□□□ 0.875e-6■■■■□ 22
PRPF4O43172 DPH1-215ENST00000576129 991 ntTSL 218.1■□□□□ 0.495e-6■■■■□ 22
PRPF4O43172 DPH1-204ENST00000570833 558 ntTSL 512.08□□□□□ -0.485e-6■■■■□ 22
PRPF4O43172 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.421e-6■■■■□ 22
PRPF4O43172 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.334e-12■■■■□ 22
PRPF4O43172 MRPS5-206ENST00000475895 1672 ntTSL 216.05■□□□□ 0.164e-12■■■■□ 22
PRPF4O43172 DNMT3A-215ENST00000496570 656 ntTSL 315.26■□□□□ 0.031e-6■■■■□ 22
PRPF4O43172 DNMT3A-209ENST00000470983 589 ntTSL 314.27□□□□□ -0.131e-6■■■■□ 22
PRPF4O43172 DNMT3A-202ENST00000321117 4279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.281e-6■■■■□ 22
PRPF4O43172 DNMT3A-204ENST00000380756 4477 ntTSL 1 (best)13.06□□□□□ -0.321e-6■■■■□ 22
PRPF4O43172 MRPS5-204ENST00000464458 648 ntTSL 312.86□□□□□ -0.354e-12■■■■□ 22
PRPF4O43172 MRPS5-207ENST00000482568 711 ntTSL 312.65□□□□□ -0.384e-12■■■■□ 22
PRPF4O43172 DNMT3A-201ENST00000264709 9501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.461e-6■■■■□ 22
PRPF4O43172 MRPS5-202ENST00000345084 1359 ntTSL 211.27□□□□□ -0.614e-12■■■■□ 22
PRPF4O43172 DNMT3A-203ENST00000380746 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.611e-6■■■■□ 22
PRPF4O43172 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.86e-7■■■■□ 22
PRPF4O43172 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.796e-7■■■■□ 22
PRPF4O43172 MFSD10-203ENST00000503596 1589 ntTSL 519.18■□□□□ 0.666e-7■■■■□ 22
PRPF4O43172 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.626e-7■■■■□ 22
PRPF4O43172 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.596e-7■■■■□ 22
PRPF4O43172 MFSD10-208ENST00000509676 1178 ntTSL 515.32■□□□□ 0.046e-7■■■■□ 22
PRPF4O43172 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.142e-6■■■■□ 22
PRPF4O43172 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.932e-6■■■■□ 22
PRPF4O43172 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.912e-6■■■■□ 22
PRPF4O43172 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.662e-6■■■■□ 22
PRPF4O43172 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.572e-6■■■■□ 22
PRPF4O43172 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.372e-6■■■■□ 22
PRPF4O43172 PLXNB2-212ENST00000496720 913 ntTSL 316.64■□□□□ 0.253e-7■■■■□ 22
PRPF4O43172 PLXNB2-202ENST00000411680 704 ntTSL 216.02■□□□□ 0.163e-7■■■■□ 22
PRPF4O43172 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.958e-7■■■■□ 22
PRPF4O43172 PNCK-231ENST00000488994 1437 ntTSL 218.38■□□□□ 0.531e-7■■■■□ 22
PRPF4O43172 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.348e-7■■■■□ 22
PRPF4O43172 TCF3-213ENST00000590436 1149 ntTSL 519.33■□□□□ 0.688e-7■■■■□ 22
PRPF4O43172 TCF3-206ENST00000585855 1170 ntTSL 319.33■□□□□ 0.688e-7■■■■□ 22
PRPF4O43172 TCF3-219ENST00000610756 1343 ntTSL 1 (best)18.36■□□□□ 0.538e-7■■■■□ 22
PRPF4O43172 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.478e-7■■■■□ 22
PRPF4O43172 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.48e-7■■■■□ 22
PRPF4O43172 TCF3-218ENST00000593064 2694 ntTSL 216.34■□□□□ 0.218e-7■■■■□ 22
PRPF4O43172 TCF3-217ENST00000592628 1751 ntTSL 515.61■□□□□ 0.098e-7■■■■□ 22
PRPF4O43172 TCF3-214ENST00000590605 541 ntTSL 215.4■□□□□ 0.068e-7■■■■□ 22
PRPF4O43172 TCF3-215ENST00000590684 1313 ntTSL 315.36■□□□□ 0.058e-7■■■■□ 22
Retrieved 100 of 20,551 protein–RNA pairs in 190 ms