Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW64

RBM22, Pre-mRNA-splicing factor RBM22, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM22Q9NW64 USP20-201ENST00000315480 4458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.264e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 USP14-208ENST00000582707 1803 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.274e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 USP20-202ENST00000358355 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.284e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 USP20-207ENST00000491731 821 ntTSL 213.29□□□□□ -0.284e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 DDX17-201ENST00000216019 6441 ntTSL 1 (best)13.28□□□□□ -0.281e-9■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 USP20-205ENST00000474895 825 ntTSL 512.75□□□□□ -0.374e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 MTPAP-205ENST00000488290 4103 ntTSL 212.67□□□□□ -0.384e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 RPL17-C18orf32-201ENST00000332968 948 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.415e-10■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 NUP88-201ENST00000225696 2194 ntTSL 512.42□□□□□ -0.424e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.483e-6■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 USP20-203ENST00000372429 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.484e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 USP14-202ENST00000383589 2168 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.484e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 RPL17-216ENST00000582935 469 ntTSL 212□□□□□ -0.496e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 RPL17-210ENST00000581091 573 ntTSL 212□□□□□ -0.496e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 ADD1-219ENST00000514940 1332 ntTSL 511.73□□□□□ -0.534e-8■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 DDI2-201ENST00000320153 2076 ntTSL 211.7□□□□□ -0.544e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 BTAF1-201ENST00000265990 7250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.554e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 EIF3L-201ENST00000381683 1599 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.554e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 USP14-203ENST00000400266 1681 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.554e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 CNOT10-219ENST00000556853 551 ntTSL 411.52□□□□□ -0.574e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 CNOT10-218ENST00000494439 551 ntTSL 511.52□□□□□ -0.574e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 HDAC2-205ENST00000519065 9874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.574e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 ADD1-210ENST00000503455 3206 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.584e-8■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 ADD1-206ENST00000398129 3787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.64e-8■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 SNRPG-207ENST00000480370 487 ntTSL 211.24□□□□□ -0.614e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 POLR2A-209ENST00000617998 6751 ntTSL 1 (best)11.24□□□□□ -0.614e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 RPRD1B-202ENST00000449186 591 ntTSL 411.16□□□□□ -0.621e-8■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 EIF3L-214ENST00000624234 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.634e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 RPRD1B-201ENST00000373433 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.634e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 NUP160-206ENST00000528071 4138 ntTSL 510.99□□□□□ -0.654e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 DDX17-205ENST00000432525 1354 ntTSL 210.85□□□□□ -0.671e-9■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 USP14-205ENST00000578942 3189 ntTSL 210.85□□□□□ -0.674e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 ADD1-211ENST00000506157 5179 ntTSL 510.66□□□□□ -0.74e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 GART-203ENST00000381815 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.714e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 SNRPG-208ENST00000482975 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.724e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 ADD1-217ENST00000513328 3107 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.724e-8■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 CLASP1-201ENST00000263710 8092 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.724e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 DDX17-207ENST00000475004 443 ntTSL 310.29□□□□□ -0.763e-9■■■■■ 29.9
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RBM22Q9NW64 RPL17-224ENST00000618619 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.795e-10■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 RPL17-207ENST00000580210 705 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.86e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 CEP95-203ENST00000556440 3139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.812e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 ADD1-214ENST00000509039 1569 ntTSL 29.77□□□□□ -0.854e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 RPL17-205ENST00000579408 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.866e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 SNRPG-204ENST00000438261 515 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.884e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 LENG8-AS1-202ENST00000429922 871 ntTSL 4 BASIC9.49□□□□□ -0.894e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 DDI2-202ENST00000480945 10625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.94e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 PPP2R2A-207ENST00000518397 830 ntTSL 59.41□□□□□ -0.94e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 PPP2R2A-202ENST00000380737 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.934e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 CLASP1-212ENST00000480007 569 ntTSL 49.23□□□□□ -0.934e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 CLASP1-215ENST00000541377 7909 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.934e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 CLASP1-203ENST00000409078 8002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.934e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 MCM8-203ENST00000378886 3835 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.944e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 EIF3D-212ENST00000496875 604 ntTSL 49.02□□□□□ -0.974e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 MCM8-204ENST00000378896 3769 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.974e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 CLASP1-202ENST00000397587 7915 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.984e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 GART-214ENST00000476524 806 ntTSL 28.95□□□□□ -0.984e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 CEP95-218ENST00000583676 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 38.88□□□□□ -0.992e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 RPL17-212ENST00000581373 584 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -15e-10■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 DDI2-203ENST00000483899 497 ntTSL 38.74□□□□□ -1.014e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 EIF3L-211ENST00000476955 583 ntTSL 58.74□□□□□ -1.014e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 ARHGAP11A-202ENST00000543522 3152 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.021e-6■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 SNRPG-203ENST00000429728 566 ntTSL 28.69□□□□□ -1.024e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 CEP95-213ENST00000581885 3641 ntTSL 1 (best)8.66□□□□□ -1.022e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 CLASP1-208ENST00000455322 5660 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.024e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 DDX17-210ENST00000497196 856 ntTSL 38.6□□□□□ -1.033e-9■■■■■ 29.9
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RBM22Q9NW64 MCM8-205ENST00000610722 7486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.044e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 CEP95-201ENST00000553412 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.052e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 MCM8-202ENST00000378883 3574 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.054e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 GPBP1-208ENST00000514387 3310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.064e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 GART-202ENST00000366093 805 ntTSL 38.36□□□□□ -1.074e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 GART-201ENST00000361093 2149 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.074e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 NPM1-208ENST00000521672 597 ntTSL 58.34□□□□□ -1.074e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 GPBP1-203ENST00000424459 4683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.094e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 KPNB1-210ENST00000580573 556 ntTSL 38.1□□□□□ -1.114e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 NUP160-210ENST00000531016 634 ntTSL 38.09□□□□□ -1.114e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 RPRD1B-208ENST00000618318 567 ntTSL 48.06□□□□□ -1.121e-8■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 GART-206ENST00000424203 3571 ntTSL 1 (best)7.88□□□□□ -1.154e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 GART-207ENST00000426819 837 ntTSL 57.85□□□□□ -1.154e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 RPL17-213ENST00000581741 596 ntTSL 27.83□□□□□ -1.166e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 GART-218ENST00000497313 457 ntTSL 37.79□□□□□ -1.164e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 CLASP1-211ENST00000474065 516 ntTSL 37.73□□□□□ -1.174e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 SNRPG-201ENST00000272348 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.184e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 RPL17-208ENST00000580261 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.195e-10■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 1012 ntTSL 57.61□□□□□ -1.196e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 AKAP8L-206ENST00000595087 796 ntTSL 27.6□□□□□ -1.194e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 ADD1-209ENST00000503169 2394 ntTSL 27.58□□□□□ -1.24e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 SNRPG-209ENST00000488400 393 ntTSL 27.57□□□□□ -1.24e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 CEP95-211ENST00000580285 2681 ntTSL 57.54□□□□□ -1.22e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 EIF3L-212ENST00000477256 1708 ntTSL 57.49□□□□□ -1.214e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 CEBPZ-201ENST00000234170 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.214e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 NUP88-205ENST00000572809 771 ntTSL 37.45□□□□□ -1.224e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 GART-204ENST00000381831 3490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.244e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 EIF3L-203ENST00000412331 3220 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.264e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 EZH2-204ENST00000469631 414 ntTSL 27.12□□□□□ -1.274e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 AKAP8L-217ENST00000600065 679 ntTSL 37.06□□□□□ -1.284e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 PTK2-221ENST00000520460 572 ntTSL 46.95□□□□□ -1.32e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 MTPAP-201ENST00000263063 5601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.34e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 NUP214-214ENST00000525561 487 ntTSL 46.91□□□□□ -1.34e-7■■■■■ 29.9
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