Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ3

CCL28, C-C motif chemokine 28, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL28Q9NRJ3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCL28Q9NRJ3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCL28Q9NRJ3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCL28Q9NRJ3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCL28Q9NRJ3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCL28Q9NRJ3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCL28Q9NRJ3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCL28Q9NRJ3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCL28Q9NRJ3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCL28Q9NRJ3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCL28Q9NRJ3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCL28Q9NRJ3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCL28Q9NRJ3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCL28Q9NRJ3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCL28Q9NRJ3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCL28Q9NRJ3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCL28Q9NRJ3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCL28Q9NRJ3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCL28Q9NRJ3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCL28Q9NRJ3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCL28Q9NRJ3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCL28Q9NRJ3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCL28Q9NRJ3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCL28Q9NRJ3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCL28Q9NRJ3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL28Q9NRJ3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL28Q9NRJ3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL28Q9NRJ3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL28Q9NRJ3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL28Q9NRJ3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL28Q9NRJ3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL28Q9NRJ3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL28Q9NRJ3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL28Q9NRJ3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL28Q9NRJ3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL28Q9NRJ3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL28Q9NRJ3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL28Q9NRJ3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL28Q9NRJ3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL28Q9NRJ3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL28Q9NRJ3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL28Q9NRJ3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL28Q9NRJ3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL28Q9NRJ3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL28Q9NRJ3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL28Q9NRJ3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL28Q9NRJ3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCL28Q9NRJ3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCL28Q9NRJ3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCL28Q9NRJ3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCL28Q9NRJ3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCL28Q9NRJ3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCL28Q9NRJ3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCL28Q9NRJ3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCL28Q9NRJ3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCL28Q9NRJ3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCL28Q9NRJ3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCL28Q9NRJ3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCL28Q9NRJ3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCL28Q9NRJ3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCL28Q9NRJ3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCL28Q9NRJ3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCL28Q9NRJ3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCL28Q9NRJ3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCL28Q9NRJ3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms