Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG5

RPRD1B, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1BQ9NQG5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms