Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG3

UBN1, Ubinuclein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBN1Q9NPG3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBN1Q9NPG3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBN1Q9NPG3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBN1Q9NPG3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBN1Q9NPG3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBN1Q9NPG3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBN1Q9NPG3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBN1Q9NPG3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBN1Q9NPG3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBN1Q9NPG3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBN1Q9NPG3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBN1Q9NPG3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
UBN1Q9NPG3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBN1Q9NPG3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBN1Q9NPG3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBN1Q9NPG3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBN1Q9NPG3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
UBN1Q9NPG3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBN1Q9NPG3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBN1Q9NPG3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBN1Q9NPG3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBN1Q9NPG3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBN1Q9NPG3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBN1Q9NPG3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBN1Q9NPG3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
UBN1Q9NPG3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBN1Q9NPG3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBN1Q9NPG3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBN1Q9NPG3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBN1Q9NPG3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBN1Q9NPG3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBN1Q9NPG3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBN1Q9NPG3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBN1Q9NPG3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBN1Q9NPG3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBN1Q9NPG3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBN1Q9NPG3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBN1Q9NPG3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBN1Q9NPG3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBN1Q9NPG3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
UBN1Q9NPG3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBN1Q9NPG3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBN1Q9NPG3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBN1Q9NPG3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBN1Q9NPG3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBN1Q9NPG3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBN1Q9NPG3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBN1Q9NPG3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBN1Q9NPG3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBN1Q9NPG3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBN1Q9NPG3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBN1Q9NPG3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBN1Q9NPG3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBN1Q9NPG3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBN1Q9NPG3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
UBN1Q9NPG3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBN1Q9NPG3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBN1Q9NPG3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBN1Q9NPG3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBN1Q9NPG3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBN1Q9NPG3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBN1Q9NPG3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBN1Q9NPG3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBN1Q9NPG3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBN1Q9NPG3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBN1Q9NPG3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBN1Q9NPG3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBN1Q9NPG3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms