Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
MTA3Q9BTC8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
MTA3Q9BTC8 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTA3Q9BTC8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTA3Q9BTC8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTA3Q9BTC8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTA3Q9BTC8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTA3Q9BTC8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTA3Q9BTC8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTA3Q9BTC8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTA3Q9BTC8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTA3Q9BTC8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTA3Q9BTC8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTA3Q9BTC8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTA3Q9BTC8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTA3Q9BTC8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTA3Q9BTC8 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MTA3Q9BTC8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTA3Q9BTC8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MTA3Q9BTC8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTA3Q9BTC8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTA3Q9BTC8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTA3Q9BTC8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTA3Q9BTC8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTA3Q9BTC8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTA3Q9BTC8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTA3Q9BTC8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTA3Q9BTC8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTA3Q9BTC8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTA3Q9BTC8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTA3Q9BTC8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTA3Q9BTC8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTA3Q9BTC8 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MTA3Q9BTC8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTA3Q9BTC8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTA3Q9BTC8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTA3Q9BTC8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MTA3Q9BTC8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTA3Q9BTC8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTA3Q9BTC8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTA3Q9BTC8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTA3Q9BTC8 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTA3Q9BTC8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTA3Q9BTC8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTA3Q9BTC8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTA3Q9BTC8 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTA3Q9BTC8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTA3Q9BTC8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTA3Q9BTC8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTA3Q9BTC8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTA3Q9BTC8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTA3Q9BTC8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTA3Q9BTC8 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTA3Q9BTC8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTA3Q9BTC8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTA3Q9BTC8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTA3Q9BTC8 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTA3Q9BTC8 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MTA3Q9BTC8 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTA3Q9BTC8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTA3Q9BTC8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTA3Q9BTC8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTA3Q9BTC8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTA3Q9BTC8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTA3Q9BTC8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTA3Q9BTC8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTA3Q9BTC8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTA3Q9BTC8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTA3Q9BTC8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MTA3Q9BTC8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTA3Q9BTC8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTA3Q9BTC8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTA3Q9BTC8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTA3Q9BTC8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTA3Q9BTC8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MTA3Q9BTC8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MTA3Q9BTC8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MTA3Q9BTC8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MTA3Q9BTC8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTA3Q9BTC8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MTA3Q9BTC8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MTA3Q9BTC8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MTA3Q9BTC8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTA3Q9BTC8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTA3Q9BTC8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTA3Q9BTC8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTA3Q9BTC8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTA3Q9BTC8 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MTA3Q9BTC8 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MTA3Q9BTC8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTA3Q9BTC8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTA3Q9BTC8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTA3Q9BTC8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTA3Q9BTC8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTA3Q9BTC8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTA3Q9BTC8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTA3Q9BTC8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTA3Q9BTC8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTA3Q9BTC8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTA3Q9BTC8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms