Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PAXIP1Q6ZW49 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PAXIP1Q6ZW49 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PAXIP1Q6ZW49 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PAXIP1Q6ZW49 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PAXIP1Q6ZW49 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PAXIP1Q6ZW49 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PAXIP1Q6ZW49 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PAXIP1Q6ZW49 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PAXIP1Q6ZW49 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PAXIP1Q6ZW49 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PAXIP1Q6ZW49 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PAXIP1Q6ZW49 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PAXIP1Q6ZW49 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PAXIP1Q6ZW49 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PAXIP1Q6ZW49 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PAXIP1Q6ZW49 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PAXIP1Q6ZW49 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PAXIP1Q6ZW49 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PAXIP1Q6ZW49 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PAXIP1Q6ZW49 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PAXIP1Q6ZW49 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PAXIP1Q6ZW49 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PAXIP1Q6ZW49 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PAXIP1Q6ZW49 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PAXIP1Q6ZW49 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PAXIP1Q6ZW49 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PAXIP1Q6ZW49 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PAXIP1Q6ZW49 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PAXIP1Q6ZW49 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PAXIP1Q6ZW49 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PAXIP1Q6ZW49 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PAXIP1Q6ZW49 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PAXIP1Q6ZW49 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PAXIP1Q6ZW49 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PAXIP1Q6ZW49 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PAXIP1Q6ZW49 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PAXIP1Q6ZW49 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PAXIP1Q6ZW49 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PAXIP1Q6ZW49 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PAXIP1Q6ZW49 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PAXIP1Q6ZW49 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PAXIP1Q6ZW49 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PAXIP1Q6ZW49 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PAXIP1Q6ZW49 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PAXIP1Q6ZW49 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PAXIP1Q6ZW49 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PAXIP1Q6ZW49 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PAXIP1Q6ZW49 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PAXIP1Q6ZW49 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PAXIP1Q6ZW49 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PAXIP1Q6ZW49 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PAXIP1Q6ZW49 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PAXIP1Q6ZW49 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PAXIP1Q6ZW49 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PAXIP1Q6ZW49 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PAXIP1Q6ZW49 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PAXIP1Q6ZW49 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PAXIP1Q6ZW49 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PAXIP1Q6ZW49 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PAXIP1Q6ZW49 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PAXIP1Q6ZW49 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PAXIP1Q6ZW49 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PAXIP1Q6ZW49 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PAXIP1Q6ZW49 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PAXIP1Q6ZW49 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PAXIP1Q6ZW49 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PAXIP1Q6ZW49 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PAXIP1Q6ZW49 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PAXIP1Q6ZW49 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PAXIP1Q6ZW49 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PAXIP1Q6ZW49 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PAXIP1Q6ZW49 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PAXIP1Q6ZW49 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PAXIP1Q6ZW49 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms