Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVU6

UFSP1, Inactive Ufm1-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFSP1Q6NVU6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms