Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE6

LCN10, Epididymal-specific lipocalin-10, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN10Q6JVE6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LCN10Q6JVE6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LCN10Q6JVE6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LCN10Q6JVE6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LCN10Q6JVE6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LCN10Q6JVE6 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LCN10Q6JVE6 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LCN10Q6JVE6 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
LCN10Q6JVE6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LCN10Q6JVE6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LCN10Q6JVE6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LCN10Q6JVE6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
LCN10Q6JVE6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LCN10Q6JVE6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LCN10Q6JVE6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LCN10Q6JVE6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LCN10Q6JVE6 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
LCN10Q6JVE6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LCN10Q6JVE6 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LCN10Q6JVE6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LCN10Q6JVE6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LCN10Q6JVE6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LCN10Q6JVE6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LCN10Q6JVE6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LCN10Q6JVE6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LCN10Q6JVE6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LCN10Q6JVE6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LCN10Q6JVE6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LCN10Q6JVE6 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
LCN10Q6JVE6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
LCN10Q6JVE6 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LCN10Q6JVE6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LCN10Q6JVE6 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LCN10Q6JVE6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LCN10Q6JVE6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LCN10Q6JVE6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LCN10Q6JVE6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LCN10Q6JVE6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LCN10Q6JVE6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LCN10Q6JVE6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LCN10Q6JVE6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LCN10Q6JVE6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LCN10Q6JVE6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LCN10Q6JVE6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LCN10Q6JVE6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
LCN10Q6JVE6 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LCN10Q6JVE6 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LCN10Q6JVE6 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LCN10Q6JVE6 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
LCN10Q6JVE6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LCN10Q6JVE6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LCN10Q6JVE6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LCN10Q6JVE6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LCN10Q6JVE6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LCN10Q6JVE6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LCN10Q6JVE6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LCN10Q6JVE6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LCN10Q6JVE6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LCN10Q6JVE6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LCN10Q6JVE6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LCN10Q6JVE6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LCN10Q6JVE6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LCN10Q6JVE6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LCN10Q6JVE6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
LCN10Q6JVE6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LCN10Q6JVE6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LCN10Q6JVE6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LCN10Q6JVE6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LCN10Q6JVE6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LCN10Q6JVE6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
LCN10Q6JVE6 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LCN10Q6JVE6 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LCN10Q6JVE6 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LCN10Q6JVE6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LCN10Q6JVE6 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LCN10Q6JVE6 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LCN10Q6JVE6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LCN10Q6JVE6 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LCN10Q6JVE6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LCN10Q6JVE6 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LCN10Q6JVE6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LCN10Q6JVE6 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LCN10Q6JVE6 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LCN10Q6JVE6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LCN10Q6JVE6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LCN10Q6JVE6 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LCN10Q6JVE6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LCN10Q6JVE6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LCN10Q6JVE6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LCN10Q6JVE6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LCN10Q6JVE6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LCN10Q6JVE6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LCN10Q6JVE6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LCN10Q6JVE6 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LCN10Q6JVE6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LCN10Q6JVE6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LCN10Q6JVE6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LCN10Q6JVE6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LCN10Q6JVE6 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LCN10Q6JVE6 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms