Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATL3Q6DD88 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms