Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG16L1Q676U5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG16L1Q676U5 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG16L1Q676U5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG16L1Q676U5 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG16L1Q676U5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG16L1Q676U5 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG16L1Q676U5 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG16L1Q676U5 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG16L1Q676U5 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG16L1Q676U5 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG16L1Q676U5 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG16L1Q676U5 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG16L1Q676U5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG16L1Q676U5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG16L1Q676U5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG16L1Q676U5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG16L1Q676U5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG16L1Q676U5 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG16L1Q676U5 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG16L1Q676U5 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG16L1Q676U5 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG16L1Q676U5 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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ATG16L1Q676U5 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG16L1Q676U5 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG16L1Q676U5 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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ATG16L1Q676U5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG16L1Q676U5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG16L1Q676U5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG16L1Q676U5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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ATG16L1Q676U5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG16L1Q676U5 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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ATG16L1Q676U5 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG16L1Q676U5 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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ATG16L1Q676U5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
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ATG16L1Q676U5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
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ATG16L1Q676U5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG16L1Q676U5 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG16L1Q676U5 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG16L1Q676U5 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
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ATG16L1Q676U5 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG16L1Q676U5 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG16L1Q676U5 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG16L1Q676U5 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG16L1Q676U5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG16L1Q676U5 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG16L1Q676U5 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG16L1Q676U5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG16L1Q676U5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG16L1Q676U5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG16L1Q676U5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG16L1Q676U5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG16L1Q676U5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG16L1Q676U5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG16L1Q676U5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG16L1Q676U5 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG16L1Q676U5 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG16L1Q676U5 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
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