Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU3

CHIC1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC1Q5VXU3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
CHIC1Q5VXU3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
CHIC1Q5VXU3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
CHIC1Q5VXU3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
CHIC1Q5VXU3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
CHIC1Q5VXU3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CHIC1Q5VXU3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CHIC1Q5VXU3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
CHIC1Q5VXU3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CHIC1Q5VXU3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CHIC1Q5VXU3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
CHIC1Q5VXU3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
CHIC1Q5VXU3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
CHIC1Q5VXU3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
CHIC1Q5VXU3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
CHIC1Q5VXU3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
CHIC1Q5VXU3 AC007919.2-201ENST00000444110 511 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
CHIC1Q5VXU3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
CHIC1Q5VXU3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
CHIC1Q5VXU3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC35.76■■■■□ 3.32
CHIC1Q5VXU3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
CHIC1Q5VXU3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.31
CHIC1Q5VXU3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
CHIC1Q5VXU3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
CHIC1Q5VXU3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
CHIC1Q5VXU3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC35.76■■■■□ 3.31
CHIC1Q5VXU3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CHIC1Q5VXU3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
CHIC1Q5VXU3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CHIC1Q5VXU3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CHIC1Q5VXU3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
CHIC1Q5VXU3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CHIC1Q5VXU3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CHIC1Q5VXU3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CHIC1Q5VXU3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CHIC1Q5VXU3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CHIC1Q5VXU3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
CHIC1Q5VXU3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CHIC1Q5VXU3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
CHIC1Q5VXU3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CHIC1Q5VXU3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
CHIC1Q5VXU3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
CHIC1Q5VXU3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
CHIC1Q5VXU3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
CHIC1Q5VXU3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
CHIC1Q5VXU3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
CHIC1Q5VXU3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
CHIC1Q5VXU3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
CHIC1Q5VXU3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
CHIC1Q5VXU3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CHIC1Q5VXU3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CHIC1Q5VXU3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CHIC1Q5VXU3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CHIC1Q5VXU3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CHIC1Q5VXU3 RPL12P24-201ENST00000474907 486 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
CHIC1Q5VXU3 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC35.73■■■■□ 3.31
CHIC1Q5VXU3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CHIC1Q5VXU3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CHIC1Q5VXU3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CHIC1Q5VXU3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CHIC1Q5VXU3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CHIC1Q5VXU3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CHIC1Q5VXU3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CHIC1Q5VXU3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
CHIC1Q5VXU3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
CHIC1Q5VXU3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC35.72■■■■□ 3.31
CHIC1Q5VXU3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
CHIC1Q5VXU3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
CHIC1Q5VXU3 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
CHIC1Q5VXU3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
CHIC1Q5VXU3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
CHIC1Q5VXU3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
CHIC1Q5VXU3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
CHIC1Q5VXU3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
CHIC1Q5VXU3 AP002856.3-201ENST00000441665 635 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
CHIC1Q5VXU3 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
CHIC1Q5VXU3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
CHIC1Q5VXU3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
CHIC1Q5VXU3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
CHIC1Q5VXU3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
CHIC1Q5VXU3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
CHIC1Q5VXU3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
CHIC1Q5VXU3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
CHIC1Q5VXU3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
CHIC1Q5VXU3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
CHIC1Q5VXU3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
CHIC1Q5VXU3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
CHIC1Q5VXU3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
CHIC1Q5VXU3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC35.7■■■■□ 3.31
CHIC1Q5VXU3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC35.7■■■■□ 3.31
CHIC1Q5VXU3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC35.7■■■■□ 3.31
CHIC1Q5VXU3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
CHIC1Q5VXU3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
CHIC1Q5VXU3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
CHIC1Q5VXU3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
CHIC1Q5VXU3 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
CHIC1Q5VXU3 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
CHIC1Q5VXU3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC35.69■■■■□ 3.3
CHIC1Q5VXU3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
CHIC1Q5VXU3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms