Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC153Q494R4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC153Q494R4 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC153Q494R4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC153Q494R4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC153Q494R4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC153Q494R4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC153Q494R4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC153Q494R4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC153Q494R4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC153Q494R4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC153Q494R4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC153Q494R4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC153Q494R4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC153Q494R4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC153Q494R4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC153Q494R4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC153Q494R4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC153Q494R4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCDC153Q494R4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCDC153Q494R4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCDC153Q494R4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms