Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 MED25-209ENST00000612791 881 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.653e-6■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 SCHLAP1-201ENST00000629145 1436 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.122e-7■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.469e-16■■■■□ 21.3
ILF3Q12906 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.169e-16■■■■□ 21.3
ILF3Q12906 GTPBP3-216ENST00000598038 2917 ntTSL 514.7□□□□□ -0.069e-16■■■■□ 21.3
ILF3Q12906 CXXC5-209ENST00000507139 472 ntTSL 421.7■■□□□ 1.062e-7■■■■□ 21.3
ILF3Q12906 CXXC5-206ENST00000504844 777 ntTSL 221.11■□□□□ 0.972e-7■■■■□ 21.3
ILF3Q12906 CXXC5-203ENST00000502336 581 ntTSL 419.61■□□□□ 0.732e-7■■■■□ 21.3
ILF3Q12906 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.472e-7■■■■□ 21.3
ILF3Q12906 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.32e-7■■■■□ 21.3
ILF3Q12906 CXXC5-214ENST00000512816 558 ntTSL 316.47■□□□□ 0.232e-7■■■■□ 21.3
ILF3Q12906 CXXC5-205ENST00000503511 506 ntTSL 216.47■□□□□ 0.232e-7■■■■□ 21.3
ILF3Q12906 CXXC5-210ENST00000509238 542 ntTSL 216.47■□□□□ 0.232e-7■■■■□ 21.3
ILF3Q12906 CXXC5-212ENST00000511457 810 ntTSL 316.33■□□□□ 0.22e-7■■■■□ 21.3
ILF3Q12906 CXXC5-202ENST00000502295 503 ntTSL 416.33■□□□□ 0.22e-7■■■■□ 21.3
ILF3Q12906 CXXC5-216ENST00000520967 878 ntTSL 315.74■□□□□ 0.112e-7■■■■□ 21.3
ILF3Q12906 CXXC5-204ENST00000502716 900 ntTSL 215.43■□□□□ 0.062e-7■■■■□ 21.3
ILF3Q12906 CXXC5-207ENST00000504944 568 ntTSL 314.1□□□□□ -0.152e-7■■■■□ 21.3
ILF3Q12906 AACSP1-202ENST00000521412 1095 ntBASIC12.33□□□□□ -0.446e-8■■■■□ 21.3
ILF3Q12906 AACSP1-201ENST00000503486 2822 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.746e-8■■■■□ 21.3
ILF3Q12906 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.092e-7■■■■□ 21.3
ILF3Q12906 HMBOX1-215ENST00000560599 1426 ntTSL 518.14■□□□□ 0.492e-7■■■■□ 21.3
ILF3Q12906 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.132e-7■■■■□ 21.3
ILF3Q12906 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.042e-7■■■■□ 21.3
ILF3Q12906 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.012e-7■■■■□ 21.3
ILF3Q12906 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.062e-7■■■■□ 21.3
ILF3Q12906 HMBOX1-213ENST00000560269 569 ntTSL 413.36□□□□□ -0.272e-7■■■■□ 21.3
ILF3Q12906 HACD3-208ENST00000566239 393 ntTSL 213.34□□□□□ -0.272e-7■■■■□ 21.3
ILF3Q12906 HACD3-207ENST00000566074 1658 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.352e-7■■■■□ 21.3
ILF3Q12906 HACD3-210ENST00000568793 1824 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.372e-7■■■■□ 21.3
ILF3Q12906 HACD3-201ENST00000261875 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.422e-7■■■■□ 21.3
ILF3Q12906 HMBOX1-203ENST00000397358 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.472e-7■■■■□ 21.3
ILF3Q12906 HMBOX1-207ENST00000519662 811 ntTSL 410.84□□□□□ -0.672e-7■■■■□ 21.3
ILF3Q12906 HMBOX1-201ENST00000287701 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.942e-7■■■■□ 21.3
ILF3Q12906 FARP1-220ENST00000596613 856 ntTSL 58.22□□□□□ -1.094e-7■■■■□ 21.3
ILF3Q12906 HMBOX1-208ENST00000521516 2216 ntTSL 27.58□□□□□ -1.22e-7■■■■□ 21.3
ILF3Q12906 HMBOX1-214ENST00000560357 979 ntTSL 27.03□□□□□ -1.282e-7■■■■□ 21.3
ILF3Q12906 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.42e-7■■■■□ 21.3
ILF3Q12906 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.592e-7■■■■□ 21.3
ILF3Q12906 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.652e-7■■■■□ 21.3
ILF3Q12906 CMIP-203ENST00000539778 3937 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.636e-7■■■■□ 21.3
ILF3Q12906 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.411e-6■■■■□ 21.3
ILF3Q12906 ACAA1-212ENST00000460424 538 ntTSL 422.95■■□□□ 1.261e-6■■■■□ 21.3
ILF3Q12906 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.11e-6■■■■□ 21.3
ILF3Q12906 ACAA1-207ENST00000440176 1328 ntTSL 220.76■□□□□ 0.911e-6■■■■□ 21.3
ILF3Q12906 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.881e-6■■■■□ 21.3
ILF3Q12906 ACAA1-206ENST00000423611 877 ntTSL 319.9■□□□□ 0.781e-6■■■■□ 21.3
ILF3Q12906 ACAA1-204ENST00000418880 737 ntTSL 319.76■□□□□ 0.751e-6■■■■□ 21.3
ILF3Q12906 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.621e-6■■■■□ 21.3
ILF3Q12906 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.61e-6■■■■□ 21.3
ILF3Q12906 ACAA1-203ENST00000411549 1944 ntTSL 1 (best)18.7■□□□□ 0.581e-6■■■■□ 21.3
ILF3Q12906 ACAA1-217ENST00000484284 580 ntTSL 218.01■□□□□ 0.471e-6■■■■□ 21.3
ILF3Q12906 ACAA1-205ENST00000421218 869 ntTSL 517.44■□□□□ 0.381e-6■■■■□ 21.3
ILF3Q12906 ACAA1-208ENST00000447223 915 ntTSL 316.23■□□□□ 0.191e-6■■■■□ 21.3
ILF3Q12906 ZNF101-201ENST00000318110 1830 ntTSL 514.91□□□□□ -0.023e-7■■■■□ 21.3
ILF3Q12906 ZNF101-203ENST00000415784 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.393e-7■■■■□ 21.3
ILF3Q12906 ZNF101-204ENST00000444249 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.683e-7■■■■□ 21.3
ILF3Q12906 ZNF101-205ENST00000541458 575 ntTSL 49.12□□□□□ -0.953e-7■■■■□ 21.3
ILF3Q12906 ZNF101-208ENST00000592502 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.213e-7■■■■□ 21.3
ILF3Q12906 SLC27A5-205ENST00000595851 2003 ntTSL 217.11■□□□□ 0.332e-7■■■■□ 21.3
ILF3Q12906 RSF1-203ENST00000467567 2982 ntTSL 213.36□□□□□ -0.276e-7■■■■□ 21.3
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ILF3Q12906 DLC1-205ENST00000506171 560 ntTSL 44.12□□□□□ -1.752e-7■■■■□ 21.3
ILF3Q12906 FARP1-240ENST00000602263 867 ntTSL 510.48□□□□□ -0.735e-7■■■■□ 21.2
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ILF3Q12906 AL669831.3-207ENST00000635509 941 ntTSL 58.83□□□□□ -15e-9■■■■□ 21.2
ILF3Q12906 AL669831.3-212ENST00000414688 421 ntTSL 52.32□□□□□ -2.041e-9■■■■□ 21.2
ILF3Q12906 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.261e-6■■■■□ 21.2
ILF3Q12906 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.971e-6■■■■□ 21.2
ILF3Q12906 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.211e-6■■■■□ 21.2
ILF3Q12906 ATF2-207ENST00000409833 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.775e-7■■■■□ 21.2
ILF3Q12906 ATF2-208ENST00000413123 681 ntTSL 510.15□□□□□ -0.785e-7■■■■□ 21.2
ILF3Q12906 ATF2-210ENST00000417080 2113 ntTSL 1 (best)10.06□□□□□ -0.85e-7■■■■□ 21.2
ILF3Q12906 ATF2-216ENST00000435231 784 ntTSL 510.04□□□□□ -0.85e-7■■■■□ 21.2
ILF3Q12906 ATF2-218ENST00000445349 483 ntTSL 48.98□□□□□ -0.975e-7■■■■□ 21.2
ILF3Q12906 ATF2-206ENST00000409635 2109 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -15e-7■■■■□ 21.2
ILF3Q12906 ATF2-219ENST00000456655 1861 ntTSL 1 (best)8.63□□□□□ -1.035e-7■■■■□ 21.2
ILF3Q12906 ATF2-209ENST00000415955 1896 ntTSL 1 (best)7.93□□□□□ -1.145e-7■■■■□ 21.2
ILF3Q12906 ATF2-213ENST00000428760 1989 ntTSL 1 (best)7.5□□□□□ -1.215e-7■■■■□ 21.2
ILF3Q12906 ATF2-203ENST00000392544 1919 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.225e-7■■■■□ 21.2
ILF3Q12906 ATF2-211ENST00000421438 1966 ntTSL 1 (best)7.23□□□□□ -1.255e-7■■■■□ 21.2
ILF3Q12906 ATF2-214ENST00000429579 2081 ntTSL 1 (best)6.99□□□□□ -1.295e-7■■■■□ 21.2
ILF3Q12906 ATF2-217ENST00000437522 883 ntTSL 56.83□□□□□ -1.325e-7■■■■□ 21.2
ILF3Q12906 ATF2-205ENST00000409499 801 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.385e-7■■■■□ 21.2
ILF3Q12906 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.525e-7■■■■□ 21.2
ILF3Q12906 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.555e-7■■■■□ 21.2
ILF3Q12906 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.575e-7■■■■□ 21.2
ILF3Q12906 PLD1-202ENST00000351298 5604 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.392e-6■■■■□ 21.2
ILF3Q12906 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.592e-6■■■■□ 21.2
ILF3Q12906 RBM39-215ENST00000442447 644 ntTSL 216.1■□□□□ 0.171e-8■■■■□ 21.2
ILF3Q12906 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.141e-8■■■■□ 21.2
ILF3Q12906 RBM39-219ENST00000453310 1068 ntTSL 215.46■□□□□ 0.071e-8■■■■□ 21.2
ILF3Q12906 RBM39-213ENST00000433027 611 ntTSL 515.04■□□□□ -01e-8■■■■□ 21.2
ILF3Q12906 RBM39-209ENST00000416529 594 ntTSL 37.58□□□□□ -1.21e-8■■■■□ 21.2
ILF3Q12906 RBM39-218ENST00000449489 432 ntTSL 57.31□□□□□ -1.241e-8■■■■□ 21.2
ILF3Q12906 RBM39-231ENST00000477334 949 ntTSL 24.09□□□□□ -1.751e-8■■■■□ 21.2
ILF3Q12906 RBM39-211ENST00000426951 840 ntTSL 1 (best)4.09□□□□□ -1.751e-8■■■■□ 21.2
ILF3Q12906 RBM39-234ENST00000487604 370 ntTSL 33.83□□□□□ -1.81e-8■■■■□ 21.2
ILF3Q12906 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.731e-6■■■■□ 21.1
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