Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CBX1P83916 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBX1P83916 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBX1P83916 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBX1P83916 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBX1P83916 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBX1P83916 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBX1P83916 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBX1P83916 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBX1P83916 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBX1P83916 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBX1P83916 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBX1P83916 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CBX1P83916 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CBX1P83916 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CBX1P83916 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CBX1P83916 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CBX1P83916 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CBX1P83916 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CBX1P83916 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CBX1P83916 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CBX1P83916 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CBX1P83916 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CBX1P83916 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CBX1P83916 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CBX1P83916 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CBX1P83916 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CBX1P83916 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CBX1P83916 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CBX1P83916 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CBX1P83916 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CBX1P83916 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CBX1P83916 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CBX1P83916 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CBX1P83916 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CBX1P83916 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CBX1P83916 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CBX1P83916 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CBX1P83916 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CBX1P83916 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CBX1P83916 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CBX1P83916 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CBX1P83916 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CBX1P83916 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CBX1P83916 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CBX1P83916 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CBX1P83916 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CBX1P83916 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CBX1P83916 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CBX1P83916 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CBX1P83916 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CBX1P83916 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CBX1P83916 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CBX1P83916 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CBX1P83916 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CBX1P83916 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CBX1P83916 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CBX1P83916 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CBX1P83916 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CBX1P83916 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CBX1P83916 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CBX1P83916 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CBX1P83916 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CBX1P83916 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CBX1P83916 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CBX1P83916 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CBX1P83916 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CBX1P83916 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CBX1P83916 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CBX1P83916 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CBX1P83916 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CBX1P83916 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CBX1P83916 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CBX1P83916 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CBX1P83916 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CBX1P83916 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CBX1P83916 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CBX1P83916 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CBX1P83916 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CBX1P83916 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CBX1P83916 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CBX1P83916 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CBX1P83916 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CBX1P83916 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CBX1P83916 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CBX1P83916 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CBX1P83916 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CBX1P83916 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CBX1P83916 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CBX1P83916 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CBX1P83916 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CBX1P83916 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CBX1P83916 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CBX1P83916 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CBX1P83916 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CBX1P83916 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CBX1P83916 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CBX1P83916 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CBX1P83916 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CBX1P83916 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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