Protein–RNA interactions for Protein: P60602

ROMO1, Reactive oxygen species modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROMO1P60602 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms