Protein–RNA interactions for Protein: P35663

CYLC1, Cylicin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLC1P35663 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms