Protein–RNA interactions for Protein: P23919

DTYMK, Thymidylate kinase, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTYMKP23919 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DTYMKP23919 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms