Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GCSHP23434 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GCSHP23434 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GCSHP23434 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GCSHP23434 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GCSHP23434 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GCSHP23434 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GCSHP23434 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GCSHP23434 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GCSHP23434 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GCSHP23434 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GCSHP23434 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GCSHP23434 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GCSHP23434 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GCSHP23434 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GCSHP23434 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GCSHP23434 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GCSHP23434 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GCSHP23434 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GCSHP23434 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GCSHP23434 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GCSHP23434 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GCSHP23434 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GCSHP23434 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GCSHP23434 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GCSHP23434 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GCSHP23434 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GCSHP23434 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GCSHP23434 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GCSHP23434 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GCSHP23434 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GCSHP23434 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GCSHP23434 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GCSHP23434 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GCSHP23434 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GCSHP23434 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GCSHP23434 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GCSHP23434 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GCSHP23434 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GCSHP23434 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GCSHP23434 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GCSHP23434 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GCSHP23434 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GCSHP23434 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GCSHP23434 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GCSHP23434 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GCSHP23434 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GCSHP23434 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GCSHP23434 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GCSHP23434 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GCSHP23434 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GCSHP23434 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GCSHP23434 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GCSHP23434 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCSHP23434 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCSHP23434 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCSHP23434 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCSHP23434 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCSHP23434 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCSHP23434 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCSHP23434 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCSHP23434 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCSHP23434 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCSHP23434 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCSHP23434 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCSHP23434 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCSHP23434 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCSHP23434 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GCSHP23434 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCSHP23434 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCSHP23434 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GCSHP23434 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCSHP23434 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCSHP23434 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCSHP23434 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCSHP23434 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GCSHP23434 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GCSHP23434 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GCSHP23434 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GCSHP23434 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GCSHP23434 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GCSHP23434 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GCSHP23434 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GCSHP23434 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GCSHP23434 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GCSHP23434 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GCSHP23434 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GCSHP23434 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GCSHP23434 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GCSHP23434 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GCSHP23434 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GCSHP23434 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GCSHP23434 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GCSHP23434 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GCSHP23434 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GCSHP23434 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GCSHP23434 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GCSHP23434 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GCSHP23434 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GCSHP23434 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms