Protein–RNA interactions for Protein: O95630

STAMBP, STAM-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPO95630 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms