Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 DNMT1-211ENST00000586988 711 ntTSL 512.63□□□□□ -0.396e-7■■■■■ 164.4
SF3B1O75533 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.81e-8■■■■■ 164.4
SF3B1O75533 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.724e-8■■■■■ 164.4
SF3B1O75533 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.264e-8■■■■■ 164.4
SF3B1O75533 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.214e-8■■■■■ 164.4
SF3B1O75533 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.024e-8■■■■■ 164.4
SF3B1O75533 RNF167-207ENST00000572430 1511 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.294e-8■■■■■ 164.4
SF3B1O75533 DENND1B-207ENST00000468589 2141 ntTSL 1 (best)25.59■■□□□ 1.694e-8■■■■■ 164.2
SF3B1O75533 DENND1B-208ENST00000477581 549 ntTSL 315.75■□□□□ 0.114e-8■■■■■ 164.2
SF3B1O75533 DENND1B-209ENST00000495550 733 ntTSL 37.74□□□□□ -1.174e-8■■■■■ 164.2
SF3B1O75533 MYO18A-207ENST00000530254 6479 ntTSL 1 (best)13.35□□□□□ -0.275e-7■■■■■ 164
SF3B1O75533 LINC02428-203ENST00000513793 438 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.998e-7■■■■■ 163.8
SF3B1O75533 TMEM189-204ENST00000371658 813 ntTSL 322.6■■□□□ 1.212e-6■■■■■ 163.7
SF3B1O75533 TMEM189-205ENST00000453505 2028 ntTSL 1 (best)20.62■□□□□ 0.892e-6■■■■■ 163.7
SF3B1O75533 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.842e-6■■■■■ 163.7
SF3B1O75533 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.432e-6■■■■■ 163.7
SF3B1O75533 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.412e-6■■■■■ 163.7
SF3B1O75533 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.372e-6■■■■■ 163.7
SF3B1O75533 CORO7-226ENST00000575531 2636 ntTSL 214.95□□□□□ -0.027e-9■■■■■ 163.7
SF3B1O75533 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.072e-6■■■■■ 163.7
SF3B1O75533 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.023e-6■■■■■ 163.6
SF3B1O75533 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.93e-6■■■■■ 163.6
SF3B1O75533 GRAMD4-204ENST00000431155 311 ntTSL 333.27■■■□□ 2.927e-7■■■■■ 163.5
SF3B1O75533 GRAMD4-205ENST00000447351 375 ntTSL 314.96□□□□□ -0.017e-7■■■■■ 163.5
SF3B1O75533 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.73e-6■■■■■ 163.4
SF3B1O75533 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.393e-6■■■■■ 163.4
SF3B1O75533 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.283e-6■■■■■ 163.4
SF3B1O75533 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.253e-6■■■■■ 163.4
SF3B1O75533 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.115e-6■■■■■ 163.2
SF3B1O75533 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.895e-6■■■■■ 163.2
SF3B1O75533 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.735e-6■■■■■ 163.2
SF3B1O75533 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.685e-6■■■■■ 163.2
SF3B1O75533 HNRNPUL1-214ENST00000599719 1473 ntTSL 1 (best)15.94■□□□□ 0.145e-6■■■■■ 163.2
SF3B1O75533 MCM3AP-201ENST00000291688 6193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.432e-6■■■■■ 163.2
SF3B1O75533 TNFRSF10A-202ENST00000519862 342 ntTSL 311.6□□□□□ -0.555e-6■■■■■ 163.2
SF3B1O75533 MCM3AP-207ENST00000486937 4593 ntTSL 211.53□□□□□ -0.562e-6■■■■■ 163.2
SF3B1O75533 MCM3AP-202ENST00000397708 6333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.732e-6■■■■■ 163.2
SF3B1O75533 MCM3AP-210ENST00000496607 4075 ntTSL 29.75□□□□□ -0.852e-6■■■■■ 163.2
SF3B1O75533 RAB31-212ENST00000583921 583 ntTSL 49.67□□□□□ -0.865e-6■■■■■ 163.2
SF3B1O75533 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.11e-6■■■■■ 163.2
SF3B1O75533 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.091e-6■■■■■ 163.2
SF3B1O75533 TUBGCP6-208ENST00000498611 5274 ntTSL 1 (best)17.9■□□□□ 0.462e-6■■■■■ 163
SF3B1O75533 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.32e-6■■■■■ 163
SF3B1O75533 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.162e-6■■■■■ 163
SF3B1O75533 EP400NL-203ENST00000392352 2172 ntTSL 225.08■■□□□ 1.615e-6■■■■■ 163
SF3B1O75533 EP400NL-205ENST00000443539 1756 ntTSL 223.78■■□□□ 1.45e-6■■■■■ 163
SF3B1O75533 EP400NL-204ENST00000407361 945 ntTSL 323.47■■□□□ 1.355e-6■■■■■ 163
SF3B1O75533 EP400NL-202ENST00000389560 1726 ntTSL 1 (best)23.25■■□□□ 1.315e-6■■■■■ 163
SF3B1O75533 EP400NL-211ENST00000539205 583 ntTSL 321.48■■□□□ 1.035e-6■■■■■ 163
SF3B1O75533 EP400NL-207ENST00000454179 781 ntTSL 221.09■□□□□ 0.975e-6■■■■■ 163
SF3B1O75533 EP400NL-209ENST00000488030 1366 ntTSL 219.27■□□□□ 0.685e-6■■■■■ 163
SF3B1O75533 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.15e-6■■■■■ 163
SF3B1O75533 ROCK2-206ENST00000462366 563 ntTSL 33.92□□□□□ -1.783e-6■■■■■ 163
SF3B1O75533 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.31e-6■■■■■ 162.9
SF3B1O75533 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.012e-6■■■■■ 162.7
SF3B1O75533 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.292e-6■■■■■ 162.7
SF3B1O75533 SLC19A1-203ENST00000417954 3572 ntTSL 1 (best)14.78□□□□□ -0.042e-6■■■■■ 162.5
SF3B1O75533 KLHL23-202ENST00000392647 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.312e-6■■■■■ 162.5
SF3B1O75533 CCDC57-205ENST00000392346 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.532e-6■■■■■ 162.5
SF3B1O75533 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.831e-6■■■■■ 162.3
SF3B1O75533 FAM49B-230ENST00000639004 837 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.72e-6■■■■■ 162.3
SF3B1O75533 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.33e-7■■■■■ 162.2
SF3B1O75533 CAPZB-207ENST00000459967 579 ntTSL 317.46■□□□□ 0.382e-7■■■■■ 162.1
SF3B1O75533 CAPZB-208ENST00000482808 660 ntTSL 217.18■□□□□ 0.342e-7■■■■■ 162.1
SF3B1O75533 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.451e-7■■■■■ 162
SF3B1O75533 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.431e-7■■■■■ 162
SF3B1O75533 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.516e-6■■■■■ 162
SF3B1O75533 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.296e-6■■■■■ 162
SF3B1O75533 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.166e-6■■■■■ 162
SF3B1O75533 PAAF1-214ENST00000544552 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.296e-6■■■■■ 162
SF3B1O75533 PAAF1-215ENST00000544909 1802 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.336e-6■■■■■ 162
SF3B1O75533 PAAF1-210ENST00000541951 1383 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.446e-6■■■■■ 162
SF3B1O75533 PAAF1-202ENST00000376384 1500 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.016e-6■■■■■ 162
SF3B1O75533 AF117829.1-205ENST00000524190 383 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.261e-7■■■■■ 162
SF3B1O75533 NUP210-202ENST00000420141 3134 ntTSL 1 (best)23.28■■□□□ 1.322e-6■■■■■ 162
SF3B1O75533 COG5-210ENST00000605888 576 ntAPPRIS ALT2 TSL 215.15■□□□□ 0.021e-6■■■■■ 161.8
SF3B1O75533 MYO18A-202ENST00000527372 9992 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.617e-7■■■■■ 161.8
SF3B1O75533 MYO18A-223ENST00000628822 7501 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.627e-7■■■■■ 161.8
SF3B1O75533 MYO18A-209ENST00000531253 7504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.627e-7■■■■■ 161.8
SF3B1O75533 MYO18A-214ENST00000533112 7522 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.697e-7■■■■■ 161.8
SF3B1O75533 PTDSS2-205ENST00000526878 3134 ntTSL 212.03□□□□□ -0.482e-6■■■■■ 161.7
SF3B1O75533 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.241e-13■■■■■ 161.6
SF3B1O75533 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.211e-6■■■■■ 161.5
SF3B1O75533 MXI1-203ENST00000361248 2188 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.081e-6■■■■■ 161.5
SF3B1O75533 SPIDR-211ENST00000519401 2090 ntTSL 211.84□□□□□ -0.511e-6■■■■■ 161.3
SF3B1O75533 MYH9-201ENST00000216181 7501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.544e-6■■■■■ 161.1
SF3B1O75533 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.182e-6■■■■■ 161
SF3B1O75533 ACAP2-215ENST00000618471 3207 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.842e-6■■■■■ 161
SF3B1O75533 NOTUM-203ENST00000477214 813 ntTSL 525.91■■□□□ 1.741e-6■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 TBC1D5-223ENST00000471679 435 ntTSL 425.31■■□□□ 1.642e-8■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 PRKCZ-208ENST00000468310 690 ntTSL 523.7■■□□□ 1.382e-6■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.324e-6■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 CARD11-202ENST00000356408 584 ntTSL 323.24■■□□□ 1.311e-6■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 PRKCZ-201ENST00000378567 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best)23.19■■□□□ 1.32e-6■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 TBC1D5-227ENST00000485432 566 ntTSL 422.64■■□□□ 1.222e-8■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.121e-8■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.094e-6■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.033e-6■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.032e-6■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 MAEA-212ENST00000509531 1001 ntTSL 1 (best)21.29■■□□□ 12e-6■■■■■ 160.8
Retrieved 100 of 46,956 protein–RNA pairs in 1832.4 ms