Protein–RNA interactions for Protein: O60356

NUPR1, Nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUPR1O60356 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms