Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
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