Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HELLSQ9NRZ9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HELLSQ9NRZ9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HELLSQ9NRZ9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
HELLSQ9NRZ9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HELLSQ9NRZ9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HELLSQ9NRZ9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HELLSQ9NRZ9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HELLSQ9NRZ9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HELLSQ9NRZ9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HELLSQ9NRZ9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HELLSQ9NRZ9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HELLSQ9NRZ9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
HELLSQ9NRZ9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HELLSQ9NRZ9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
HELLSQ9NRZ9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HELLSQ9NRZ9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HELLSQ9NRZ9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HELLSQ9NRZ9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HELLSQ9NRZ9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HELLSQ9NRZ9 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HELLSQ9NRZ9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HELLSQ9NRZ9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HELLSQ9NRZ9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
HELLSQ9NRZ9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HELLSQ9NRZ9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
HELLSQ9NRZ9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HELLSQ9NRZ9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HELLSQ9NRZ9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HELLSQ9NRZ9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HELLSQ9NRZ9 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HELLSQ9NRZ9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HELLSQ9NRZ9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HELLSQ9NRZ9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HELLSQ9NRZ9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HELLSQ9NRZ9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HELLSQ9NRZ9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HELLSQ9NRZ9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HELLSQ9NRZ9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HELLSQ9NRZ9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HELLSQ9NRZ9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HELLSQ9NRZ9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HELLSQ9NRZ9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HELLSQ9NRZ9 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HELLSQ9NRZ9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HELLSQ9NRZ9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HELLSQ9NRZ9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HELLSQ9NRZ9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HELLSQ9NRZ9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HELLSQ9NRZ9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HELLSQ9NRZ9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HELLSQ9NRZ9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HELLSQ9NRZ9 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HELLSQ9NRZ9 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HELLSQ9NRZ9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HELLSQ9NRZ9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HELLSQ9NRZ9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HELLSQ9NRZ9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HELLSQ9NRZ9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HELLSQ9NRZ9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HELLSQ9NRZ9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HELLSQ9NRZ9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HELLSQ9NRZ9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HELLSQ9NRZ9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HELLSQ9NRZ9 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HELLSQ9NRZ9 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HELLSQ9NRZ9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HELLSQ9NRZ9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HELLSQ9NRZ9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HELLSQ9NRZ9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HELLSQ9NRZ9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HELLSQ9NRZ9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HELLSQ9NRZ9 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HELLSQ9NRZ9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HELLSQ9NRZ9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HELLSQ9NRZ9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HELLSQ9NRZ9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HELLSQ9NRZ9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HELLSQ9NRZ9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HELLSQ9NRZ9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HELLSQ9NRZ9 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HELLSQ9NRZ9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HELLSQ9NRZ9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HELLSQ9NRZ9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HELLSQ9NRZ9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HELLSQ9NRZ9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
HELLSQ9NRZ9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HELLSQ9NRZ9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HELLSQ9NRZ9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HELLSQ9NRZ9 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
HELLSQ9NRZ9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HELLSQ9NRZ9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HELLSQ9NRZ9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HELLSQ9NRZ9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HELLSQ9NRZ9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HELLSQ9NRZ9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
HELLSQ9NRZ9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HELLSQ9NRZ9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HELLSQ9NRZ9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HELLSQ9NRZ9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms