Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB8

GPCPD1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPCPD1Q9NPB8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPCPD1Q9NPB8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPCPD1Q9NPB8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPCPD1Q9NPB8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPCPD1Q9NPB8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPCPD1Q9NPB8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPCPD1Q9NPB8 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPCPD1Q9NPB8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPCPD1Q9NPB8 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPCPD1Q9NPB8 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPCPD1Q9NPB8 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPCPD1Q9NPB8 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPCPD1Q9NPB8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPCPD1Q9NPB8 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPCPD1Q9NPB8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPCPD1Q9NPB8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPCPD1Q9NPB8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPCPD1Q9NPB8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPCPD1Q9NPB8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GPCPD1Q9NPB8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPCPD1Q9NPB8 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPCPD1Q9NPB8 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPCPD1Q9NPB8 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPCPD1Q9NPB8 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPCPD1Q9NPB8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPCPD1Q9NPB8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPCPD1Q9NPB8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPCPD1Q9NPB8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPCPD1Q9NPB8 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPCPD1Q9NPB8 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPCPD1Q9NPB8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPCPD1Q9NPB8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPCPD1Q9NPB8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPCPD1Q9NPB8 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GPCPD1Q9NPB8 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GPCPD1Q9NPB8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPCPD1Q9NPB8 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPCPD1Q9NPB8 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPCPD1Q9NPB8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPCPD1Q9NPB8 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPCPD1Q9NPB8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPCPD1Q9NPB8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPCPD1Q9NPB8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GPCPD1Q9NPB8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GPCPD1Q9NPB8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPCPD1Q9NPB8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPCPD1Q9NPB8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPCPD1Q9NPB8 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPCPD1Q9NPB8 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPCPD1Q9NPB8 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GPCPD1Q9NPB8 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPCPD1Q9NPB8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPCPD1Q9NPB8 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPCPD1Q9NPB8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPCPD1Q9NPB8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPCPD1Q9NPB8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPCPD1Q9NPB8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPCPD1Q9NPB8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPCPD1Q9NPB8 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPCPD1Q9NPB8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPCPD1Q9NPB8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPCPD1Q9NPB8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPCPD1Q9NPB8 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPCPD1Q9NPB8 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GPCPD1Q9NPB8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPCPD1Q9NPB8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPCPD1Q9NPB8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPCPD1Q9NPB8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPCPD1Q9NPB8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPCPD1Q9NPB8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPCPD1Q9NPB8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPCPD1Q9NPB8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPCPD1Q9NPB8 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GPCPD1Q9NPB8 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GPCPD1Q9NPB8 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPCPD1Q9NPB8 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPCPD1Q9NPB8 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPCPD1Q9NPB8 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPCPD1Q9NPB8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPCPD1Q9NPB8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPCPD1Q9NPB8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPCPD1Q9NPB8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPCPD1Q9NPB8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPCPD1Q9NPB8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPCPD1Q9NPB8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPCPD1Q9NPB8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPCPD1Q9NPB8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPCPD1Q9NPB8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPCPD1Q9NPB8 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPCPD1Q9NPB8 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPCPD1Q9NPB8 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPCPD1Q9NPB8 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GPCPD1Q9NPB8 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPCPD1Q9NPB8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPCPD1Q9NPB8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPCPD1Q9NPB8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPCPD1Q9NPB8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPCPD1Q9NPB8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPCPD1Q9NPB8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPCPD1Q9NPB8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms