Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTA3Q9BTC8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MTA3Q9BTC8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTA3Q9BTC8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTA3Q9BTC8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTA3Q9BTC8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTA3Q9BTC8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTA3Q9BTC8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTA3Q9BTC8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MTA3Q9BTC8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTA3Q9BTC8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTA3Q9BTC8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTA3Q9BTC8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms