Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV8

SIKE1, Suppressor of IKBKE 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1Q9BRV8 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms