Protein–RNA interactions for Protein: Q99928

GABRG3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRG3Q99928 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms