Protein–RNA interactions for Protein: Q8TB72

PUM2, Pumilio homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM2Q8TB72 KANSL1-208ENST00000574590 5147 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.582e-8■■■■■ 34.1
PUM2Q8TB72 KANSL1-211ENST00000575318 4935 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.632e-8■■■■■ 34.1
PUM2Q8TB72 KANSL1-201ENST00000262419 5309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.682e-8■■■■■ 34.1
PUM2Q8TB72 KANSL1-205ENST00000572904 4973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.982e-8■■■■■ 34.1
PUM2Q8TB72 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -01e-6■■■■■ 34.1
PUM2Q8TB72 MDH2-203ENST00000432020 1548 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.323e-31■■■■■ 34.1
PUM2Q8TB72 MDH2-204ENST00000443006 2020 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.433e-31■■■■■ 34.1
PUM2Q8TB72 MDH2-201ENST00000315758 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.583e-31■■■■■ 34.1
PUM2Q8TB72 ABL2-204ENST00000502732 12144 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.616e-7■■■■■ 34.1
PUM2Q8TB72 PALB2-204ENST00000566069 626 ntTSL 55.12□□□□□ -1.598e-8■■■■■ 34.1
PUM2Q8TB72 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.545e-55■■■■■ 34.1
PUM2Q8TB72 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.035e-55■■■■■ 34.1
PUM2Q8TB72 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.035e-55■■■■■ 34.1
PUM2Q8TB72 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.085e-55■■■■■ 34.1
PUM2Q8TB72 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.085e-55■■■■■ 34.1
PUM2Q8TB72 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.225e-55■■■■■ 34.1
PUM2Q8TB72 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.324e-9■■■■■ 34.1
PUM2Q8TB72 HPF1-203ENST00000515204 548 ntTSL 22.62□□□□□ -1.994e-9■■■■■ 34.1
PUM2Q8TB72 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.731e-6■■■■■ 34.1
PUM2Q8TB72 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.41e-8■■■■■ 34.1
PUM2Q8TB72 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.441e-8■■■■■ 34.1
PUM2Q8TB72 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.156e-8■■■■■ 34.1
PUM2Q8TB72 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.236e-8■■■■■ 34.1
PUM2Q8TB72 CXorf40B-203ENST00000370406 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.396e-8■■■■■ 34.1
PUM2Q8TB72 CXorf40B-201ENST00000355203 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.716e-8■■■■■ 34.1
PUM2Q8TB72 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.417e-13■■■■■ 34
PUM2Q8TB72 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.172e-21■■■■■ 34
PUM2Q8TB72 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.132e-21■■■■■ 34
PUM2Q8TB72 KDM2B-209ENST00000538503 6676 ntTSL 513.11□□□□□ -0.311e-8■■■■■ 34
PUM2Q8TB72 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.361e-8■■■■■ 34
PUM2Q8TB72 WDR60-204ENST00000454771 812 ntTSL 414.8□□□□□ -0.041e-7■■■■■ 34
PUM2Q8TB72 WDR60-203ENST00000444851 2769 ntTSL 1 (best)13.05□□□□□ -0.321e-7■■■■■ 34
PUM2Q8TB72 WDR60-202ENST00000407559 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.361e-7■■■■■ 34
PUM2Q8TB72 WDR60-205ENST00000467220 5410 ntTSL 212.3□□□□□ -0.441e-7■■■■■ 34
PUM2Q8TB72 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.432e-6■■■■■ 34
PUM2Q8TB72 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.022e-8■■■■■ 34
PUM2Q8TB72 NFIA-202ENST00000371184 1348 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.62e-8■■■■■ 34
PUM2Q8TB72 NFIA-203ENST00000371185 1714 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.862e-8■■■■■ 34
PUM2Q8TB72 NFIA-212ENST00000485903 1674 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.052e-8■■■■■ 34
PUM2Q8TB72 NFIA-206ENST00000371191 1916 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.052e-8■■■■■ 34
PUM2Q8TB72 NFIA-213ENST00000493627 696 ntTSL 1 (best)8.22□□□□□ -1.092e-8■■■■■ 34
PUM2Q8TB72 NFIA-208ENST00000407417 2123 ntTSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.122e-8■■■■■ 34
PUM2Q8TB72 NFIA-204ENST00000371187 2683 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.392e-8■■■■■ 34
PUM2Q8TB72 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.527e-8■■■■■ 34
PUM2Q8TB72 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.417e-8■■■■■ 34
PUM2Q8TB72 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.37e-8■■■■■ 34
PUM2Q8TB72 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.17e-8■■■■■ 34
PUM2Q8TB72 SLC9A6-207ENST00000636092 4697 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -17e-8■■■■■ 34
PUM2Q8TB72 SLC9A6-209ENST00000636347 4867 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.017e-8■■■■■ 34
PUM2Q8TB72 SLC9A6-213ENST00000637234 4691 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.067e-8■■■■■ 34
PUM2Q8TB72 SLC9A6-214ENST00000637581 4872 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.167e-8■■■■■ 34
PUM2Q8TB72 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.417e-8■■■■■ 34
PUM2Q8TB72 SUN1-206ENST00000413171 4488 ntTSL 510.95□□□□□ -0.664e-7■■■■■ 33.9
PUM2Q8TB72 SUN1-202ENST00000389574 3812 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.854e-7■■■■■ 33.9
PUM2Q8TB72 SUN1-205ENST00000405266 4062 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.924e-7■■■■■ 33.9
PUM2Q8TB72 SUN1-210ENST00000425407 3868 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.934e-7■■■■■ 33.9
PUM2Q8TB72 SUN1-203ENST00000401592 3953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.984e-7■■■■■ 33.9
PUM2Q8TB72 SUN1-219ENST00000452783 3717 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.984e-7■■■■■ 33.9
PUM2Q8TB72 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.138e-8■■■■■ 33.9
PUM2Q8TB72 ZMIZ1-202ENST00000446377 6686 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.458e-8■■■■■ 33.9
PUM2Q8TB72 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.921e-6■■■■■ 33.9
PUM2Q8TB72 LDLR-208ENST00000558518 3617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.693e-10■■■■■ 33.9
PUM2Q8TB72 CEP76-209ENST00000590143 2380 ntTSL 1 (best)16.33■□□□□ 0.23e-9■■■■■ 33.9
PUM2Q8TB72 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.23e-9■■■■■ 33.9
PUM2Q8TB72 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.163e-9■■■■■ 33.9
PUM2Q8TB72 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.841e-8■■■■■ 33.8
PUM2Q8TB72 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.446e-12■■■■■ 33.8
PUM2Q8TB72 SMIM15-202ENST00000507416 584 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.552e-17■■■■■ 33.8
PUM2Q8TB72 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.142e-8■■■■■ 33.8
PUM2Q8TB72 SMARCAD1-204ENST00000457823 4649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.612e-7■■■■■ 33.8
PUM2Q8TB72 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.012e-7■■■■■ 33.8
PUM2Q8TB72 SMARCAD1-202ENST00000359052 5017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best)2.28□□□□□ -2.052e-7■■■■■ 33.8
PUM2Q8TB72 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.271e-8■■■■■ 33.8
PUM2Q8TB72 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.241e-8■■■■■ 33.8
PUM2Q8TB72 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.381e-8■■■■■ 33.8
PUM2Q8TB72 TMEM189-205ENST00000453505 2028 ntTSL 1 (best)19.18■□□□□ 0.661e-18■■■■■ 33.8
PUM2Q8TB72 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.631e-18■■■■■ 33.8
PUM2Q8TB72 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.21e-18■■■■■ 33.8
PUM2Q8TB72 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.071e-18■■■■■ 33.8
PUM2Q8TB72 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.211e-18■■■■■ 33.8
PUM2Q8TB72 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.585e-7■■■■■ 33.8
PUM2Q8TB72 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.165e-7■■■■■ 33.8
PUM2Q8TB72 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.235e-7■■■■■ 33.8
PUM2Q8TB72 AKNA-209ENST00000492875 3894 ntTSL 212.4□□□□□ -0.425e-7■■■■■ 33.8
PUM2Q8TB72 AKNA-201ENST00000223791 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.455e-7■■■■■ 33.8
PUM2Q8TB72 AKNA-202ENST00000307564 7380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.515e-7■■■■■ 33.8
PUM2Q8TB72 HEATR6-204ENST00000587003 3566 ntTSL 1 (best)9.33□□□□□ -0.925e-7■■■■■ 33.8
PUM2Q8TB72 HEATR6-203ENST00000585976 3288 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.055e-7■■■■■ 33.8
PUM2Q8TB72 HEATR6-212ENST00000613428 3287 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.055e-7■■■■■ 33.8
PUM2Q8TB72 HEATR6-201ENST00000184956 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.135e-7■■■■■ 33.8
PUM2Q8TB72 HEATR6-205ENST00000587314 687 ntTSL 37.78□□□□□ -1.165e-7■■■■■ 33.8
PUM2Q8TB72 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.021e-6■■■■■ 33.7
PUM2Q8TB72 SRP72-204ENST00000507126 2181 ntTSL 1 (best)3.44□□□□□ -1.862e-9■■■■■ 33.7
PUM2Q8TB72 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.622e-6■■■■■ 33.6
PUM2Q8TB72 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.642e-6■■■■■ 33.6
PUM2Q8TB72 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.116e-8■■■■■ 33.6
PUM2Q8TB72 ARPC5-203ENST00000367534 622 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.456e-8■■■■■ 33.6
PUM2Q8TB72 ARPC5-202ENST00000359856 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.66e-8■■■■■ 33.6
PUM2Q8TB72 ARPC5-204ENST00000462965 2455 ntTSL 24.88□□□□□ -1.636e-8■■■■■ 33.6
PUM2Q8TB72 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.142e-6■■■■■ 33.6
Retrieved 100 of 17,637 protein–RNA pairs in 174.5 ms