Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYT3

CCDC170, Coiled-coil domain-containing protein 170, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC170Q8IYT3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC170Q8IYT3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC170Q8IYT3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC170Q8IYT3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC170Q8IYT3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC170Q8IYT3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC170Q8IYT3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC170Q8IYT3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC170Q8IYT3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC170Q8IYT3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC170Q8IYT3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC170Q8IYT3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC170Q8IYT3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC170Q8IYT3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC170Q8IYT3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC170Q8IYT3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC170Q8IYT3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC170Q8IYT3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC170Q8IYT3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC170Q8IYT3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC170Q8IYT3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC170Q8IYT3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC170Q8IYT3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC170Q8IYT3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC170Q8IYT3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC170Q8IYT3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC170Q8IYT3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC170Q8IYT3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC170Q8IYT3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC170Q8IYT3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC170Q8IYT3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC170Q8IYT3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC170Q8IYT3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC170Q8IYT3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC170Q8IYT3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC170Q8IYT3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC170Q8IYT3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC170Q8IYT3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC170Q8IYT3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC170Q8IYT3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC170Q8IYT3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC170Q8IYT3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC170Q8IYT3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC170Q8IYT3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC170Q8IYT3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC170Q8IYT3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC170Q8IYT3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC170Q8IYT3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC170Q8IYT3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC170Q8IYT3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC170Q8IYT3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC170Q8IYT3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC170Q8IYT3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC170Q8IYT3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC170Q8IYT3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC170Q8IYT3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC170Q8IYT3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC170Q8IYT3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC170Q8IYT3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC170Q8IYT3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC170Q8IYT3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC170Q8IYT3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC170Q8IYT3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC170Q8IYT3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC170Q8IYT3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC170Q8IYT3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC170Q8IYT3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC170Q8IYT3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC170Q8IYT3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC170Q8IYT3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC170Q8IYT3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC170Q8IYT3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC170Q8IYT3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC170Q8IYT3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC170Q8IYT3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC170Q8IYT3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC170Q8IYT3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC170Q8IYT3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC170Q8IYT3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC170Q8IYT3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC170Q8IYT3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC170Q8IYT3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC170Q8IYT3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms