Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms