Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYDE1Q6ZW31 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms