Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms