Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms